Snake verscheen al twee keer eerder op je PSP-systeem in de stijlvolle Metal Gear Acid-kaartspellenreeks. Met Metal Gear Solid: Portable Ops is de klassieke gameplay uit de uitgebreidere Metal Gear Solid-reeks voor het eerst beschikbaar op dit platform. Portable Ops pakt de draad van de grootse gebeurtenissen uit Metal Gear Solid 3: Snake Eater (PlayStation 2) weer op. Naked Snake bevindt zich nu in Zuid-Amerika. Daar probeert hij een raketcrisis te bezweren die is veroorzaakt door zijn voormalige eenheid FOXHOUND.